傳統的熱灌裝可以分為兩種，一種是高溫熱灌裝，一種是低溫灌裝后再將產品升溫到６５℃～７５℃進行巴氏殺菌。這兩種方式無需對產品、瓶子和蓋子進行單獨滅菌，只需將產品在高溫下保持足夠長的時間即可對瓶子和蓋子進行殺菌。無菌冷灌裝首先需要將產品、瓶子、蓋子分別進行殺菌，然后在無菌環境下進行灌裝，直至完全密封后才能離開無菌環境。從兩者工藝流程圖對比來看，最大的區別就是飲料受熱時間不同。我們都知道，熱處理時間越長，對飲料的品質和口感影響越大。無菌冷灌裝采用ＵＨＴ超高溫瞬間殺菌，對物料的熱處理時間不超過３０秒，并且在高溫情況下完全可以保證殺菌效果；而熱灌裝采用的殺菌方式使物料較長時間處在高溫狀態下，在一定程度上會影響產品的品質、口感和色澤，而且多數熱灌裝飲料都加有防腐劑。
無菌冷灌裝使用的吹瓶機吹瓶速度快，耗電少；而熱灌裝吹瓶機吹瓶速度比較慢，耗電量大，在同樣生產能力的情況下，投資是冷灌裝吹瓶機的３倍。
